苹果树腐烂病是有一种弱寄生性的真菌引起的，病菌以菌丝体、分生孢子器及子囊壳在病树及砍伐的病残枝的皮层中越冬。



防治方法：要想杜绝苹果树腐烂病，就要抓好平时的水肥和修剪管理，如果纯粹靠药物治疗治，那是标不治本。
 
一是加强果园土肥水管理增强树势。可重施有机肥，增施无机肥，特别是钾肥，配合适量微量元素肥，提高土壤肥力；改善土壤的团粒结构，增加土壤的通透性，抑制病害的发生。注意改善果园的排灌设施，科学用水，尽量不要大水漫灌或串灌；有条件的果园，应当采用滴灌或渗灌方式，注意做到旱灌涝排，减轻病害的发生​
 
二是合理整形修剪和负载。创造良好的果园通风透光条件，提高树体的光合效应，培养健壮的树势，增强树体的抗病能力，预防病害的发生。不可一次修剪过重，造成树体伤口过多，这样会削弱了树势，容易引起腐烂病的发生，特别是间伐大枝要逐年分步实施。尽量减少并保护各种伤口、剪锯口、环割口等，及时涂药保护。同时要疏花疏果，控制留果量，合理负载，避免大小年现象的发生。
 
三是清园药及物防治处理。加强果园检查，清除病菌，刮除表面溃疡，降低越冬病菌的滋生条件。认真清洁果园，及时剪除病枝，刮除病斑、粗老翘皮等集中带出园外销毁。要认真刮除患病处：用快刀把病部变色组织及相连的5毫米左右的好皮也刮干净，要深达木质部，边缘整齐光滑没有毛茬，有利于病斑愈合，刮后涂药妥善保护伤口。入冬前，可用生石灰、20波美度石硫合剂、食盐和水，按照6:1:1:18比例混合，也可加少量动物油，自制成涂白剂涂白树干，可防治冻害及日灼伤，兼有杀虫防病的作用。也可随着冬春修剪，用好愉快噻霉酮（涂杆喷雾型）10倍液进行涂干2-3次，或者800-1000倍+40%扑介脱1000-1200倍喷雾，可杀死大量的潜伏病菌，有效防止腐烂病菌的侵染。
 
防治腐烂病的药物有：3%抑霉唑膏剂、1.8%辛菌胺醋酸盐水剂、3%甲基硫菌灵糊剂、1.2%辛菌胺水剂、20%丁香菌脂悬浮剂、4.5%腐殖酸·硫酸铜水剂等，可任选其一涂在刮除后的部位。
 
四是施肥管理。苹果根系在一年的生长期内有2-3次生长高峰，生长高峰也是吸收肥料的高峰期，能发挥肥料的最大利用率。
 
第一次在早春2月下旬到4月上旬，土壤解冻后。此时应该施入全年总速效氮肥的50%，总速效磷肥的60%，还可施入生物菌肥，促进萌芽、抽枝、展叶、开花、座果等。实际用量亩施16-8-16的复合肥150斤左右，如果枝不旺加20-30斤尿素，同时还可以施入生物有机肥200斤左右。
 
第二次在夏季5-6月麦收前后。此时应施入全年总速效氮肥的50%，总速效磷肥的40%，速效钾肥一次全部施入，还可施入生物菌肥，施肥的作用是促进种胚的发育、花芽分化和果实膨大等。实际用量亩施16-8-16的复合肥150斤左右，如果上年果不好加入50-80斤硫酸钾。
 
第三次在秋季9-10月白露前后。此时应施入全部的有机肥、各种中量元素和微量元素以及迟效肥料，还可施入生物菌肥。最好施商品有机肥，如果施用农家肥，必须提前充分腐熟。除了有机肥以外，就是的氮磷钾复合肥和中微量元素肥料，开沟深施，施到毛细根集中的土壤里。