生物菌肥用于农业生产中能够获得特定的肥料效应，可作为化学肥料的有益补充。目前，中国生产应用的生物菌肥可分为固氮菌类、解磷菌类、解钾菌类、光合细菌类、菌根菌类、抗生菌类、复合菌类等。



生物菌肥作为一种生物制剂与化学肥料相比具有以下特点：
【1】不破坏土壤结构、保护生态、不污染环境，对人、畜和植物无毒无害；
【2】肥效持久；
【3】提高作物产量和改进作物产品品质；
【4】成本低廉；
【5】有些种类的生物肥料对作物具有选择性；
【6】其效果往往受到土壤条件（如养分、有机质、水分、酸碱度等）和环境因素（如温度、通气、光照等）的制约；
【7】一般不能与杀虫剂、杀菌剂（真菌或细菌农药）混用；
【8】易受紫外线的影响，不能长期暴露于阳光照射下。

生物菌肥的施用技巧
 
生物菌肥的施用上有一定的要求，不宜久放，最好随购随用。施用前应存放在阴凉干燥处，避免受热、受潮及阳光直射，且不能同时与化学肥料直接高温造粒。生物肥是活性物质，它在施用上对土壤条件有一定的要求，如温度、水分和酸碱度等指标，因此使用时一定要注意使用条件，否则难以获得良好的使用效果。
 
（1）施用方法
生物菌肥的施用方法较多，主要有拌种、穴施、基肥、追肥、蘸根、种肥、淋芽、沾蔓等。不同肥料对不同的作物有最适宜施用方法、施用量和施用时间。在因施用方法不同而引起的产量或品质差异不显著的情况下，就需考虑哪种方法更省工省时、经济有效。
 
田间试验表明，在李树幼果期根际浇施微生物肥料 5~10mL/株 1~2 次，可明显增强树势，提高果实品质，增加产量，其中以浇施 10mL/株 2 次的效果最明显。以用微生物肥料 450~1 500mL/hm2 拌种对棉花都有增产作用，但 1 500mL/hm2 用量效果最佳；水稻用菌根菌肥拌土法比浸根法的增产效果更好。
 
（2）施用条件
土壤类型、质地、pH 值、肥力和水分条件都会影响施入土壤的生物菌肥中的微生物的生长发育，从而影响肥效。土壤含水量对生物菌肥的肥效有显著的影响，当土壤含水量高于 9%时，菌肥的施用可以促进土壤碱解氮的增加。随着土壤含水量的增加，菌肥的促进作用增强，当含水量为 13%~16%时，土壤碱解氮值最大，菌肥的作用最强。土壤含水量低于 13%或高于16%时，菌肥对土壤碱解氮的作用均受到限制